Sinónimo de diana terapéutica
ResumenLa gran cantidad de recursos in silico y datos de perfiles de alto rendimiento disponibles actualmente en la investigación en ciencias de la vida ofrecen la posibilidad de ayudar al proceso de descubrimiento de genes y fármacos para el cáncer. Aquí proponemos aprovechar estos recursos para desarrollar una herramienta, TARGETgene, para identificar eficientemente los impulsores de las mutaciones, las posibles dianas terapéuticas y los candidatos a fármacos en el cáncer. La sencilla interfaz gráfica de usuario permite un mapeo y análisis rápido e intuitivo a nivel de sistemas. Los usuarios pueden encontrar, seleccionar y explorar genes diana identificados y compuestos de interés (por ejemplo, nuevos genes del cáncer y sus procesos biológicos enriquecidos), y validar las predicciones utilizando genes de referencia definidos por el usuario (por ejemplo, genes diana detectados en pantallas de ARNi) y genes del cáncer curados a través de TARGETgene. Las capacidades de alto nivel de TARGETgene también se demuestran a través de dos aplicaciones en este trabajo. Las predicciones en estas dos aplicaciones fueron validadas satisfactoriamente por varias vías, incluyendo genes cancerígenos conocidos, resultados de pantallas de ARNi, anotaciones de funciones genéticas y genes diana de fármacos que han sido utilizados o están en ensayo clínico en tratamientos contra el cáncer. TARGETgene está disponible gratuitamente en el sitio web Biomedical Simulations Resource (http://bmsr.usc.edu/Software/TARGET/TARGET.html).
Objetivo molecular
El Dr. Todd Golde es cofundador de Lacerta Therapeutics, Inc. y Andante Biologics Inc. y forma parte de sus consejos consultivos científicos (SAB). Forma parte del consejo asesor de Promis Neuroscience, Inc. En el pasado ha formado parte, ad hoc, de consejos consultivos relacionados con programas de enfermedades neurodegenerativas para Eli Lilly, Novartis, Bristol Myers Squib, Abbvie, Lundbeck, Biogen y Pfizer. Ha formado parte del consejo asesor médico y científico de la Asociación de Alzheimer. Es asesor científico y participa en la revisión de subvenciones para la BrightFocus Foundation y la American Federation for Aging Research. Es coinventor de múltiples patentes y solicitudes de patentes relacionadas con la terapéutica de la EA. El Dr. Duane A. Mitchell es titular de patentes relacionadas que han sido licenciadas a iOncologi, Inc.
Virol J 18, 66 (2021). https://doi.org/10.1186/s12985-021-01526-yDownload citationShare this articleAnyone you share the following link with will be able to read this content:Get shareable linkSorry, a shareable link is not currently available for this article.Copy to clipboard
Ejemplos de objetivos terapéuticos
El descubrimiento moderno de fármacos se basa principalmente en la búsqueda y posterior ensayo de candidatos a fármacos que actúan sobre una diana terapéutica preseleccionada. Los avances en la genómica, la estructura de las proteínas, la proteómica y los mecanismos de las enfermedades han provocado un creciente interés y esfuerzo por encontrar nuevas dianas y una exploración más eficaz de las existentes. El número de dianas de fármacos comercializados y en fase de investigación ha aumentado considerablemente en los últimos 8 años. Hay 1535 dianas recogidas en la base de datos de dianas terapéuticas en comparación con las ∼500 dianas comunicadas en una revisión de 1996. El conocimiento de estas dianas es útil para la disección molecular del mecanismo de acción de los fármacos y para predecir las características que guían el diseño de nuevos fármacos y la búsqueda de nuevas dianas. Este artículo resume el progreso de la exploración de dianas e investiga las características de las dianas actualmente exploradas para analizar su secuencia, estructura, representación familiar, asociación a vías, distribución en tejidos y características de localización en el genoma para encontrar pistas útiles para la búsqueda de nuevas dianas. Se discuten las posibles «reglas» para guiar la búsqueda de proteínas farmacológicas y la viabilidad de utilizar un método de aprendizaje estadístico para predecir las proteínas farmacológicas directamente a partir de sus secuencias.
Base de datos de dianas terapéuticas
En la última década, hemos experimentado una explosión de nueva información sobre las dianas terapéuticas del cáncer. Muchas de las dianas han sido validadas por el descubrimiento y la aprobación de nuevos medicamentos que han sido aprobados para el tratamiento del cáncer. A raíz de estos éxitos, innumerables nuevas dianas y nuevas terapias potenciales están siendo desarrolladas por muchos grupos diferentes, incluyendo agencias gubernamentales, empresas farmacéuticas, empresas de biotecnología, instituciones académicas e investigadores individuales. Por lo tanto, comprender el «universo» en expansión de las terapias contra el cáncer se está volviendo imposible y no existe ninguna fuente única que sirva de referencia para las partes implicadas. Además, las partes interesadas tienen áreas de experiencia muy diferentes, desde la ciencia centrada en el laboratorio hasta la investigación clínica, pasando por la supervisión corporativa y regulatoria. El texto se actualizaría cada dos años, o más a menudo según el ritmo de los cambios, el interés y las ventas. Aunque sea útil en línea, es probable que este libro de referencia se conserve también en formato impreso.